Genjutsu jest to sztuka iluzji i hipnozy, stosowana tylko przez wykwalifikowanych w tym kierunku ninja. Techniki z tej dziedziny są często używane do przejęcia kontroli nad umysłem przeciwnika i wprowadzeniu go w stan dezorientacji, obłędu czy też uśpienia.

Dzieki GenJutsu:
- Koszt Czakry GenJutsu zmniejsza sie o połowę,
- Możesz uczyć sie GenJutsu za połowę PN,
- Możesz wydostać się z każdego GenJutsu za 2x większą ilość chakry niż wymaga utworzenie tego GenJutsu.
- Możesz wprowadzić przeciwnika w paraliżujące GenJutsu. To GenJutsu paraliżuje tylko ręce. Wystarczy spojrzeć przeciwnikowi w oczy. Wróg zachowuje jasność umysłu i może poruszać innymi częściami ciała. Tylko ręce się nie poruszają. Koszt takiego GenJutsu jest zależne od rangi przeciwnika:

Uczeń Akademii - 500 Chakry
Genin - 1.000 Chakry
Chunnin - 1.500 Chakry
Jounin Specjalny - 2.000 Chakry
Jounin - 2.500 Chakry
Hunter-nin - 3.000 Chakry
Sannin - 3.500 Chakry
Legendarny Sannin - 4000 Chakry
Kage - 4.500 Chakry
Sage - 5.000 Chakry